代谢网络

代谢网络

研究微生物代谢网络的结构、功能和调控机制

研究关键词

代谢网络系统生物学代谢工程通量分析

研究详情

代谢网络研究是系统生物学的核心内容,通过分析细胞内复杂的生化反应网络,我们可以理解生命的基本运作机制。

研究内容


代谢网络重建

构建微生物的全基因组代谢模型:
  • 基因组注释和功能预测
  • 代谢途径数据库构建
  • 网络拓扑结构分析
  • 代谢流量计算

  • 代谢调控机制

    研究代谢网络的调控机制:
  • 转录调控网络
  • 酶活性调节
  • 代谢物反馈调节
  • 信号转导途径

  • 代谢工程应用

    利用代谢网络知识进行工程改造:
  • 代谢途径优化
  • 产物产量提升
  • 新代谢途径设计
  • 工业菌株改良

  • 研究方法


    采用多种系统生物学方法:
  • 宏基因组学分析
  • 代谢组学技术
  • 通量平衡分析
  • 约束条件优化
  • 机器学习算法

  • 技术平台


    建立了完善的代谢网络分析平台:
  • 代谢网络数据库
  • 代谢模型构建工具
  • 通量分析软件
  • 可视化分析系统

  • 重要成果


    深海微生物代谢网络

    构建了多种深海微生物的全基因组代谢模型,揭示了其独特的代谢特征。

    代谢工程应用

    成功应用代谢网络分析指导了生物基化学品的生产优化。

    应用前景


    代谢网络研究具有广泛的应用价值:
  • 生物制药工业
  • 生物燃料生产
  • 环境生物修复
  • 个性化医疗
  • - 合成生物学

    相关发表论文

    Zhang, K.#, Zhao, W.#, Rodionov, D., et al. (2021). Genome-Scale Metabolic Model of Caldicellulosiruptor bescii Reveals Optimal Metabolic Engineering Strategies for Bio-based Chemical Production. mSystems, 6(3), e0135120.

    研究合作

    我们欢迎与国内外研究机构和学者在代谢网络领域开展合作研究。 如果您对我们的研究感兴趣,请随时联系我们。

    国际影响

    我们的研究成果在国际学术界产生了重要影响,与多个国际知名研究机构建立了长期合作关系。

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